朝鲜中宗22年，王为了躲避宫中出现的怪物而迁宫。电影改编自这段史实，讲述了威胁王的「物怪」（诡异的物件）与觊觎王位的循旧势力展开的争斗。
故事从朝鲜燕山君被谋反势力废位，晋城大君（中宗）登上王位后，朝廷的权力掌握在了协助他登上王位的原谋反势力中，国家也陷入了一片混乱之中。一群老百姓被认为染上了疫病，被集体屠杀，只有一个小女孩被好心的侍卫救走。
各地官员向朝鲜中宗上奏折禀报在仁王山出现凶恶的怪兽祸害人间，但是，朝廷的大臣们却不相信有怪兽出没，称是有谣言惑众。
中宗指责是领相借口怪兽出没动摇民心来压制王权，决心亲自调查物怪出没的捏造案件。
两个乡下猎人埋伏在山中捕猎，但是怎样也抓不到猎物。其中一个居然被自己设置的陷阱捕获。他们和收养的女孩小明悠闲的生活在一起，小明一直想去汉阳，但是父亲一直不同意。
一天一个穿着体面的两班贵族来到他们家。小明第一次知道了原来自己的养父是原来宫中的内禁卫将尹谦，是保护王的武士。
内禁卫将尹谦过惯了乡间的打猎生活，不愿意回到宫中。但是，中宗亲自来到这里，恳求他能回宫助自己一臂之力。
当年，朝鲜王室为了掩盖村子所谓的疫情，杀光了所有的村民，内禁卫将尹谦看不过去，拼命救下了最后一个小女孩，带着她离开了王宫。
中宗向尹谦道出实情，自己本来准备改革朝廷的体制，但是，掌握兵权的兵判借口疫情爆发，搅得人心惶惶，阻止了中宗的改革措施。最后不得已，才对被称为染上瘟疫的村子的村民展开屠杀。现在，兵判等大臣又借口物怪出没，又想扰乱朝廷，恳求尹谦能帮助自己找出物怪的真正原因。
尹谦思考一晚上后，决定重回宫中，帮助中宗找出物怪。小明知道能去汉阳了，欣喜万分。
一群巫女道士在仁王山作法，欲赶走出没在仁王山的物怪。但是，物怪突然出现了，把他们都杀掉了，只有一个偷东西吃的小女孩逃脱了。
尹谦三人来到了汉阳，对汉阳的衰败赶到不可思议。当他们正在吃饭的时候，中宗的宣传官告诉他们发生了物怪吃人事件，他们赶忙前往发生命案的仁王山。
在询问逃脱的偷吃东西的小女孩时，小女孩说出了是物怪杀人，尹谦感到非常的诧异。但是，小明却发现了蹊跷，巫女做法事的绳子被人为的割断了。
尹谦跟踪小女孩时，发现了小女孩与一个黑衣人联络，黑衣人给了小女孩一包东西。尹谦跟踪小女孩，来到她的住处，看到她从黑衣人这里拿的一包东西原来是食物，分给同样是流浪的小孩子们吃。尹谦质问她是否真正看到物怪了，小女孩称其实没看到物怪，是有人答应给她食物，她才说谎的。
正当他们分析案发现场看到的场景时，一个逃脱的包袱商人来到了村子里，告诉尹谦，他确实看到了物怪，然后就死了。
尹谦来到众多包袱商遇害的现场，被惨烈的现场惊到，黏黏的液体散发出恶心的味道。
小明在验尸的时候，发现尸体上的脓包不同寻常，让宣传官去抓老鼠来做实验。尹谦告诉中宗，在仁王山被害的巫女一行人是被人杀死的，并非是怪兽。但是，包袱商的尸体显示，真的有物怪出没，而且还能传播瘟疫。尹谦判断，是真的有物怪，请求中宗派士兵搜捕。
中宗要求调运士兵抓捕物怪，但是遭到众多大臣们的反对。最后，领相称可以调集捉虎甲士去抓物怪，其实这些捉虎甲士都是他的私兵而已。中宗最后同意由捉虎甲士组成搜查队，任命尹谦为队长。
但是，一些士兵开始强征老百姓去抓捕物怪，还不顾老百姓的意愿，抢走了老百姓的粮食。
内禁卫将尹谦带着一群百姓进山搜寻物怪，领相的部下也带着甲士过来搜索。最后，两队开始分头搜索。搜索队的一个老头子发现了物怪的踪迹，大家进入山谷，发现了被物怪啃食过的动物的骨架，原来物怪是真的存在的。
领相的部下突然下手屠杀了一起搜寻物怪的老百姓，并对内禁卫将尹谦他们进行屠杀，最后，只有尹谦和小明以及宣传官等人被领相的士兵擒获，其他人都被杀害了。
领相的部下告诉尹谦，根本没有物怪存在，都是编出来吓唬百姓的，为了阻止朝鲜中宗的改革。小明也回忆起，原来领相的部下，就是当年杀死自己父母的真正凶手，小明和宣传官被踢下了山崖，还好被悬崖勾住。
正当领相的部下准备杀死尹谦时，物怪出现了，一头巨大的怪兽从山崖下爬了出来，一口一口的吃掉了领相部下带的所有官兵，仅仅剩下领相的部下几个人逃了出去。
尹谦进入悬崖下，找到还生还的小明和宣传官。他们发现最先发现物怪踪迹的老头子躲在物怪的巢穴中，他告诉大家用物怪的黏液涂在自己身上，避免被物怪发现。物怪回到巢穴后，果然没有发现他们，一口一口吃着尸体。
众人通过巢穴中的一个山洞准备逃出去，没想到被睡着的物怪发现了，紧急关头，尹谦吸引物怪的注意，掩护大家逃跑，最后大家都顺利逃脱了。
领相的部下回到宫中汇报真的有物怪出现，领相却不相信，借机向朝鲜中宗发难。
尹谦一行人顺着水流漂到了朝鲜王室的后宫，老头子告诉大家，原来物怪是朝鲜前一个王，燕山君饲养的专门的驯兽房中玩乐的。当年，这里圈养了很多只这样的怪兽。燕山君经常在这里享乐，自己就是喂养这些怪兽的饲养员，当燕山君被废的时候，军队进入，把这些怪兽都杀死了，他自己心怀善念，放走了一直很小的怪兽。
这时候，物怪从下水道也冲了进来，老头子想通过摇铃来控制物怪，把他关起来，但是，没成功，被物怪吃掉了。
领相率兵发动兵变了，借由物怪的名义，拉拢民心。
尹谦等人从关押物怪的地下牢房逃了出来，来到王宫，面见中宗。中宗知道真的有物怪，非常惊讶，这时，他的身边已经没有护卫了，领相带兵冲了进来，欲杀死中宗夺取王位。小明和宣传官等人也被领相的手下控制了。
但是，正当领相以为胜券在握时，物怪从地下冲了出来，干掉了所有领相的部下。小明和宣传官等人也趁机逃了出来。
此时，领相还念念不忘杀掉中宗，并亲自向物怪射箭，但是，依然没什么用处，手下的侍卫一个个被物怪干掉。最后，当领相自以为抓住物怪的时候，物怪挣扎逃脱了。
尹谦决定把物怪引诱到圈养怪兽的调隽坊，用炸药炸死物怪。
小明和幸存的搜索队百姓揭露了领相的阴谋，把领相等人关在宫中。最后，物怪出来后，在众目睽睽之下一口吃掉了领相。
当物怪准备冲出王宫时，尹谦放箭，吸引着物怪进入了当年圈养怪兽的调隽坊。最后，尹谦在小明和宣传官等人的帮助下，成功吸引物怪进入了调隽坊，炸死了物怪。
最后，尹谦和好友一起离开了王宫，小明和宣传官也在一起了。
《物怪》这部电影在豆瓣的评分只有5.3分，也许不是一部成功的电影，但至少它也能启示我们，权力和野兽，只有一步之遥。能守住自己的内心底线的人，绝不至于衣冠禽兽。