抗生素抗性基因产品简介
自20世纪发现抗生素以来,其被广泛应用于人类医疗、家禽养殖、畜牧业及水产养殖业,大大促进了人类社会的发展,但是抗生素滥用的情况和危害近些年来也愈发严重。抗生素的过度使用和滥用导致了环境中抗生素抗性细菌(Antibiotic resistance bacteria, ARB)和抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes, ARGs)的出现,ARGs已被确定为“新兴的环境污染物”,目前在污水处理厂、养殖水域、地表水、饮用水、土壤、沉积物以及空气等不同的环境介质中已发现。其不但会对生态环境造成破坏,而且会通过食物链进入人体内,对公共健康和食品、饮水安全等构成威胁。世界卫生组织已将抗生素抗性基因作为21世纪威胁人类健康的最大挑战之一。
定量实时PCR(q-PCR)已被广泛应用于检测环境ARGs,微分基因是国内首家推出抗生素抗性基因检测的公司,使用高通量PCR平台可以检测的ARGs种类多,通量大,周期短,性价比高, 形式灵活多样。
产品优势
1、超高通量,一张芯片5184个反应;
2、仅需非常少量的样品;
3、每个反应100nl, 节约PCR反应试剂;
4、检测模式灵活多样;
5、极少的手工操作,减少加样误差及PCR反应板之间的偏差;
6、节约实验时间,极大缩短项目周期。
产品介绍
一、检测目的
检测环境样本中抗生素抗性基因的种类、丰度及相关性分析。
二、工作流程及流程详解
01、确定检测基因
本产品提供296个检测基因
标准套餐包含:284种ARGs+8个转座酶基因+2个整合子基因+16S基因(内参)
284个抗生素抗性基因根据抗生素分为8组,氨基糖苷类,β-内酰胺类,氟喹诺酮类/喹诺酮类/氟苯尼考/氯霉素/安非他酮,大环内酯类/林可酰胺/链阳性菌素B(MLSB),磺胺类,四环素类,万古霉素和其他。
老师可以根据自己的研究在我们的基因内表中挑选感兴趣的基因进行检测;也可以自己提供基因,通过引物验证后进行检测。
检测模式选择:
每张芯片5184个反应孔,仪器提供引物和样本不同组合的加样模式,老师可以根据自己的项目,灵活选择检测基因数,建议一个样本3个技术性重复。(如选择48引物x108个样品模式,可做36个样品三重复,或27个样品四重复)
02、样本准备
根据研究目的,选取特定环境的土壤、水体、粪便、空气等样本,提取全部细菌DNA,使用高通量qPCR仪进行检测。
高通量qPCR流程:
03、数据分析
ARGs检出统计图
ARGs聚类热图
样本间ARGs关联性circos图
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