人类基因组研究的主要内容
单基因遗传病
单基因遗传病是受一对等位基因控制的遗传病,目前已知的单基因遗传病已达6600多种,常见的疾病包括红绿色盲、血友病、白化病等。
多基因遗传病
复杂性疾病的发生与发展受到多个基因控制、遗传不呈现经典的孟德尔遗传模式,并且受到多种环境因素影响。
肿瘤与癌症
癌症是机体在环境污染、化学污染、电离辐射、自由基毒素、微生物及其代谢毒素、遗传特性、内分泌失衡、免疫功能紊乱等等各种致癌物质、致癌因素的作用下导致身体正常细胞发生癌变的结果。
分子生物学的研究已经发现2.5万多种与癌症相关的基因变异,这个数字还在增加。
老师在研究这些内容的大前提是,能够找到合适的样本,测序得到变异数据后,再进行功能验证而得到一个理想的结果。所以一切研究都是以样本的选取而开始。那么就由小编带大家了解一下,不同研究内容的选样建议。
单基因遗传病研究
家系样本
隐性遗传病
寻找家系中子代有的纯合突变或者复合杂合突变。
· 核心家系的正常父母及患病子女
· 3-4 例样本
显性遗传病
寻找家系患者共有但在正常个体中不存在的杂合突变。
· 至少选择 2 个病例(最好 4 个)和一个正常个体
· case 尽量选择亲缘关系较远的样本, control 尽量选择与病患个体亲缘关系较近的样本。
新发突变
家系显示无遗传病史,寻找家系中患者有而父母没有的纯合或者杂合突变
· 核心家系的正常父母及患病子女
· 最好有多个家系样本
散发样本
根据实际情况选择样本,建议最好有文献报道或者有 OMIM 记载,否则很可能该疾病与遗传无关。建议选择 20 例以上病患样本。
多基因遗传病研究
家系样本
携带易感基因的家系
小家系: 选择不少于 30 个核心家系(包含患儿和一对健康父母)
大家系: 尽量选取更多位于家族不同分支上的患者
散发样本
如需要进行全基因组关联分析,建议选择至少 100 对 case 和 control ,且样本选取地区尽可能广泛、样本量越大关联到的位点/基因可信度越高。
肿瘤研究
1. 来自同一个体的肿瘤样本与正常组织样本(癌旁);
2. 来自同一个体的肿瘤样本与血液。
PS: 如果需要进行肿瘤高级分析,建议成对样本不少于 30 对。
肿瘤高级分析包括肿瘤突变特征谱、高频突变基因分析、高频 CNV 等。