宁、延熹遗意。卒于扬州，年五十。《广印人传、画友录、中国艺术家征略、歙县志、述学》篆刻

他的篆刻喜用“涩刀”，直追秦汉，境界甚高，成为清代中期一位声名显赫的篆刻大家。巴慰祖临摹古印，浸淫秦汉，功底非凡，得汉印之神而又有自己的特色。巴慰祖自刻的“莲舫”铜印一枚，庄严典重，温厚静穆，上密下疏，平稳自然。他制作的朱文印“遗稿天留”，石质雕刻精美，印文构造精密，线条畅达，神采飞扬，具金石意趣。白文印“深得酒仙三昧”，为寿山红半山巧色巧雕双狮钮印章，工整秀劲，构思极精，字体紧凑，疏中有密，笔道变化多端，朱底厚重，白底跃动，耐人玩味。巴慰祖作印，无论朱白、无论大小，皆能紧紧把握住稳健、静穆的格调，无丝毫浮躁之气。因而，他比当时的印家更多了一分深邃感。这应该与他力摹古玺汉印，仿制青铜彝器，琢砚造墨，长期把玩上古器物，心摹手追大有关系。巴慰祖著有《四香堂摹印》、《百寿图印谱》留传。