原文摘自:
Colonic Mucosal Microbiota in Colorectal Cancer: A Single-Center Metagenomic Study in Saudi Arabia
原文作者:
Ahmed O. Alomair及其团队
沙特阿拉伯KFMC(法哈德国王医学城)
该文于2018年发表在《Gastroenterology Research and Practice》
背景和目的:
目前已知肠道微生物群因遗传和地理存在差异,本研究的重点是通过宏基因组分析来确定沙特阿拉伯结直肠癌(CRC)患者特异的微生物群。
方法:
从2010年7月至2012年11月,就诊于该院的结直肠癌患者参加了宏基因组学研究。所有接受临床、内镜和组织学评估。通过在结肠的统一区段用蒸馏水喷射结肠粘膜来从每位患者收集粘膜微生物群样品,随后在结肠镜检查期间进行抽吸。在使用Illumina平台的宏基因组测序之前提取总量纯化的dsDNA并进行定量。对20例满意的DNA样本进行宏基因组学研究,随后进行全面的系统发生分析,并检查了同样数量的健康的年龄匹配的对照组的结肠粘膜微生物群。
结果:
分析29名年龄在38-77岁之间的患者(14名女性)的宏基因组学数据。大多数患者(11名,37%)超重(BMI =25-30)。18名患者(62%)存在直肠出血,11名患者(37%)存在有症状的贫血。其中,直肠癌14例(48%)、盲肠癌8例(27%)、结肠肝曲癌1例(3%)、降结肠癌2例(6%)、横结肠癌4例(13%)。这项研究确定了结直肠癌患者与对照组相比特异存在的11个菌属。与对照组相比,发现脆弱拟杆菌和梭形杆菌在癌症组中显著普遍存在。
结论:
研究对沙特阿拉伯结直肠癌患者的微生物群进行了深入的研究,并且发现与对照组相比,这些患者中存在显著不同的菌属。(见图1和图2)