封建社会是一个专制的社会，封建统治者非常注重自己的绝对权威，常常要求属下对自己绝对服从。当他们的权威受到属下否定时，除非在政治需要的情况下，会采取宽容的态度，否则，往往会采取不同的方式进行制裁，甚至不惜剥夺对方的生命，来维护自己的权威和尊严，这是曹操诛杀华佗的真正原因。

官渡一战之后，曹操平定了北方，成为当时的实际统治者，朝中的大臣劝他进封为魏王。这使曹操的自尊心权力欲得到了极大满足。他和多数封建统治者一样，在自己位高权重的时候，就想在各个方面来突出自己的威严。虽说曹操效仿周文王没有称帝，但在他的内心，自己就是皇帝，下属就是臣子，他的号令、他的意见就是铁律，下属必须无条件执行，否则必须严惩。正因如此，他的属下绝大多数对他是尽心尽力、尽忠尽勇，久而久之，他的实际地位远远超过了汉献帝。

华佗从小饱读经书，深受儒家思想影响，作为一名医生，他身怀济世救民的理想。在曹操成为实际统治者之后，就驾空了汉献帝，华佗自然就会有不愿与曹操为伍的想法，在曹操“使佗专视”情况下，他就以“妻病”为由，返回家乡。即使是曹操多次下诏催促，华佗仍不理会。因此，华佗违抗了曹操的命令，欺骗了曹操，使曹操的政治权威受到了否定，使曹操的自尊心受到了伤害。这对于曹操来说是无法忍受的，华佗犯了“不从征召罪”和“大不敬罪”，即便是苟彧以“佗术实工，人命所县，宜含宥之”来为华佗求情，但曹操还是依据汉律处死了华佗。

其实，华佗当时在曹操眼里已经成了“无用”之人，也是一个原因。曹操是一个实用主义者，在曹操的身上无时无刻不体现着一种实用主义精神。曹操有矛盾的双重性格，他有时嗜杀成性，有时又悲天悯人；他既宽容仁让，又睚眦必报。他为报父仇，征伐陶谦，死者数万；为保全自己，杀掉了吕伯奢全家。同时他又对百姓极其体恤，他能够宽容写檄文辱骂他的陈琳，又容不下对其立过汗马功劳的荀氏叔侄。这看似矛盾的性格事实上很好解释，其实曹操做事的一个准则就是实用。一个简单的法则就是对我有用则留，无用则诛。

为了自己的政治目的，他可以不计前嫌，重用有杀子之仇的张绣，将反复无常的张鲁一家封为列侯。当他认为一个人危及自己的利益，又对自己没有“使用价值”的时候，便毫不留情，他处死了边让、袁忠、杨修、孔融等，逼死荀彧、荀攸。但他在杀死杨修之后又带着重礼去探望其父杨彪；逼死荀彧、荀攸之后又下令褒奖他们，厚待他们的后人。这些行为也只不过是出于大局和政治的需要。

对于华佗也是如此，在曹操看来，华佗不愿意给自己“专视”，返乡不归，有能力治好又不治好自己的病，让自己饱受病痛的折磨。华佗触犯了自己的权威，即便是华佗对天下的百姓有用，但对自己已是“无用”的人，曹操认为便没有留的必要。