RNA是以DNA的一条链为模板，以碱基互补配对原则，转录形成的一条单链，主要功能是使遗传信息能够翻译成蛋白行使生物学功能，是遗传信息向表型转化过程中的桥梁。当我们研究DNA的表达和调控，即我们常说的转录组测序时，首先需要做的就是从组织或细胞中分离和纯化RNA。

抽提RNA时，我们通常遵从3点原则：1.保证RNA的完整性；2.获得比较纯的RNA；3.操作简便，稳定性强。

RNA用于不同的后续实验，其质量要求不尽相同。cDNA文库构建要求RNA完整而无酶反应抑制物残留；Northern对RNA完整性要求较高，对酶反应抑制物残留要求较低；RT-PCR对RNA完整性要求不太高，但对酶反应抑制物残留要求严格。因此，做转录组测序抽提RNA之前，明确实验目的是进行后续实验的首要条件。

RNA抽提的方法有很多，其中常用的方法为Trizol抽提法和RNA抽提试剂盒。Trizol抽提方法为传统的抽提方法，RNA试剂盒抽提则比较方便，市面上也有很多该类试剂盒。这两种方法在操作过种种各有利弊。在做转录组测序时，我们可以根据自己的目的选择合适的方法，下面列举出了2种方法的优缺点对比，供参考。

做转录组测序时，我们为了保证抽提出的RNA的质量，每一个细节都需要谨慎操作，下面几点则是我们常常会忽视但是又很重要的小细节。

1.使用正确的细胞或组织储存条件，在样品用液氮速冻后，应该储存在-80℃，做转录组测序的样品在RNA提取之前应避免反复冻融。

2.研磨过程要迅速，彻底匀浆样品。

3.尽量使用无RNase的枪头、试管和溶液，手套也应经常更换；实验前移液器、工作台、玻璃器皿，尽量用RNaseZap擦拭。

4.建议分装RNA溶液进行保存，避免反复冻融，导致RNA降解。

5.使用Rnase-free的双蒸去离子水或其它缓冲液溶解RNA，否则容易导致RNA降解。

6.转录组测序时，我们一定要结合组织样本本身的特点，选择合适的抽提方案。