单细胞专题(二)| 我们的生老病死,被“它”看得透透的

在上一篇肿瘤疾病专题中提到(小伙伴们在文末可查看对应链接),若把细胞类型鉴定是单细胞测序的“看家本领”,那么区分细胞发育特征、重构它们之间的分化路径,就是单细胞转录组(scRNA-seq)的另一项重要应用。

单细胞转录组测序技术可以帮助揭示机体细胞功能和分子调控机制,改变了人们对独特细胞类型和信号通路的理解,对于机体的生长发育和疾病研究有着重要作用。具体来说,scRNA-seq在生长发育研究中的应用方向大致可以包括:胚胎发育、组织/器官分化、衰老死亡等等。

接下来跟着小编通过几篇高分文章走进单细胞在生长发育中的应用吧!

1、胚胎发育

文章标题:Generation of Blastocyst-lik e Structures from Mouse Embryonic and Adult Cell Cultures

发表期刊:Cell

影响因子:38.637

发表时间:2019.10

DOI: 10.1016/j.cell.2019.09.029

文章概要

1.人工诱导多能干细胞EPS拥有分化为囊胚样结构潜能,具备完整三胚层结构;

2.Bulk RNA-Seq和scRNA-Seq证实了EPS类囊胚体与自然囊胚的相似性;

3.体内/体外实验表明,EPS有发育为成熟胚胎的潜能,并可由成熟体细胞诱导;

4.以上结果预示了制造完全人工胚胎(人工生命)的可能性。

2、细胞分化

文章标题:A Human Skeletal Muscle At las Identifies the Trajectories of Stem and Progenitor Cells across Developm ent and from Human Pluripotent Ste m Cells

发表期刊:Cell Stem Cell

影响因子:20.860

发表时间:2020.05

DOI: 10.1016/j.stem.2020.04.017

文章概要

1.首次构建了详尽的人类早期胚胎至成年阶段下,骨骼肌组织的细胞发育图谱;

2.由人类多能干细胞(HSC)体外诱导分化形成的骨骼肌细胞,被确定对应于产前早期发育7-12周的前体细胞;

3.可被用于分子参照,以便更好地阐明骨骼肌体内发育机制,以及体外分子特征;

4.基于所揭示的重要信号通路、基因模块及转录因子,以期利用体外产生具有优异功能的骨骼肌细胞,来修复和治愈肌肉损伤与退化。

3、组织生长

文章标题:The Molecular Anatomy of Mouse Skin during Hair Growth and Rest

发表期刊:Cell Stem Cell

影响因子:20.860

发表时间:2020.02

DOI: 10.1016/j.stem.2020.01.012

文章概要

1.使用scRNA-Seq和原位mRNA染色来表征毛发生长和静息期间的小鼠皮肤;

2.制定了毛囊静息期、生长期,全层皮肤的细胞组成全景图;

3.发现了外根鞘(ORS)两个新的细胞亚群,且其中的Msx2+基质细胞是转录未定型的(干细胞特征)。

4、衰老

文章标题:Single-Cell Transcriptomic Atlas of Primate Ovarian Aging

发表期刊:Cell

影响因子:38.637

发表时间:2020.01

DOI: 10.1016/j.cell.2020.01.009

文章概要

1.年轻和老年非人类灵长类动物(NHPs)的卵巢,单细胞转录组揭示了7种具有不同基因表达特征的卵巢细胞(卵母细胞+6种卵巢体细胞);

2.卵母细胞有四个发育阶段亚型,其中,早期卵母细胞和颗粒细胞中的抗氧化信号显著变化,对衰老相关的氧化应激更为敏感;

3.老年卵巢的颗粒细胞中,存在抗氧化途径失活、活性氧增加、细胞凋亡等现象;

4.灵长类动物卵巢在单细胞分辨率下的细胞图谱,揭示了新的诊断生物标志物(bioma rker),及与年龄相关的人类卵巢疾病的潜在治疗靶点。

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