据福建省政府网站消息，9月12日，福建省委书记尹力视频连线莆田、仙游和泉州、厦门，听取当前疫情防控措施落实情况，部署下一步工作。国务院联防联控机制综合组福建工作组组长、国家卫生健康委员会副主任李斌在莆田视频现场指导。省长王宁参加连线并提出工作落实要求。

据国家卫健委最新通报，9月12日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例49例。其中本土病例22例（均在福建，其中莆田市15例、泉州市6例、厦门市1例），含2例由无症状感染者转为确诊病例（均在福建）。无新增疑似病例。早前的9月11日0～24时，福建省报告新增本土确诊病例20例（泉州市报告1例，莆田市报告19例），其中无症状感染者转确诊1例；报告新增本土无症状感染者18例（泉州市报告1例、莆田市报告17例），上述泉州报告2例感染者的工作地和感染地均为莆田市，现住地为泉州市，两者地域相邻。

尹力视频连线疫情防控一线时指出，在国务院联防联控机制综合组福建工作组的有力指导下，莆田疫情防控工作有序有效展开。目前疫情防控进入关键时刻，大家要清楚认识当前疫情形势的严峻性复杂性，清醒认识当前疫情防控工作的艰巨性紧迫性，与时间赛跑，坚决打赢疫情防控歼灭战。要快速有力开展工作，按照方案进一步抓好核酸检测、流调溯源、隔离管控等工作落实，找准和解决工作上的差距、落实中的不足，不断健全会商机制、反馈机制、专家研判机制、信息报送机制，确保防控各项工作紧起来、严起来、实起来、快起来。坚持防疫“全省一盘棋”，各方面全力配合，心往一处想，劲往一处使，把各种力量都集中调动起来，强化摸排监测、信息推送，齐心协力抓好外防输出、内防扩散各项工作，坚决遏制疫情蔓延。

他强调，要切实加强组织领导，强化疫情防控指挥体系，实行集中办公、扁平化管理，提高指挥协调效能。要发动群众、服务群众，抓好联防联控、群防群控，加强宣传引导，及时回应社会关切，确保社会大局安定稳定。

2021年9月11日，福建莆田九华医院在九华溪公园河边凉亭处设置临时室外核酸检测点，满足市民检测需求。人民视觉 图根据莆田市人民政府新闻办公室在9月10日晚间的通报，此轮疫情最先是在莆田市按规程落实“适时抽检”工作中，对仙游县枫亭镇一小学在校学生进行新冠病毒核酸检测时发现的。

莆田市疾控中心主任凌龙美介绍称，当地会对开学后的在校学生例行开展每半个月10%的核酸适时抽检。9月9日晚，仙游县总医院在检测中发现有两份样本（混采管）检测结果呈阳性。随后，又对涉及的20名学生实施单采检测，9月10日7点，检测发现该校两名学生，是亲兄弟，检测结果呈阳性，为此次疫情首个阳性病例。

随后，当地立即扩大核酸采样，结果又发现有4人（1名学生和3名学生家长）核酸检测结果呈阳性。截至９月10日18时，共发现6人检测结果为阳性。经专家研判，其中１名学生家长林某杰疑似为本次疫情源头。

在9月10日的官方通报中，对林某杰的流调情况进行了介绍。林某杰于8月4日乘坐厦门航空MF852航班自新加坡从厦门机场入境，在厦门进行集中隔离14天后，于8月19日点对点转运至仙游县集中隔离点继续集中隔离。根据福建省的疫情防控办法，林某杰在完成14+7天的集中隔离之后，于8月26日开始实行7天的居家健康监测。官方通报还表示，在入境后21天集中隔离期间，林某杰共进行了9次核酸检测和1次血清检测，结果均为阴性，在9月10日确诊之前，林某杰已经入境38天。

9月11日，莆田市卫健委主任姚冰珊在新闻发布会上表示，目前已将此次疫情部分相关病例的标本送至福建省疾控中心进行基因测序，结果初步判定为德尔塔毒株。

9月11日晚，国家卫健委副主任李斌率国务院联防联控机制综合组福建工作组抵闽指导莆田疫情防控工作。李斌通报了国务院联防联控机制关于疫情处置和防控的部署要求。他指出，党中央、国务院高度重视福建莆田疫情防控，工作组将与大家齐心协力，落实科学精准规范有序防控要求，扎实做好外防输出、内防扩散各项工作，以最快速度控制疫情，共同打好疫情防控这场硬仗。

另外在9月12日，福建省卫健委再次组织厦门、三明、漳州、龙岩、宁德市卫健委派出核酸检测应急采样队1505人前往莆田支持推进全员核酸检测工作。

同时，由福建省立医院组成的省级援莆医疗队61人，以及福建中医药大学附属第一、第二、第三医院的中医专家3人也于当日前往莆田支援。截至12日，全省共有4辆移动核酸检测车驰援莆田，国家紧急医学救援队应急车、福建省疾控中心调配的福建省立医院移动实验室、厦门泉州两地移动核酸检测设备也先后抵达。