新冠肺炎疫情在台延烧多日，民进党当局卫生主管部门负责人陈时中的防疫指挥能力屡遭质疑，关于他是否会被撤换的传言不断。民进党前“立委”郭正亮曾透露，蔡英文前副手陈建仁会扮演一个角色，外界也猜测，陈建仁会不会去当“疫情指挥中心”的召集人或是顾问。尽管蔡英文办公室出面否认了此事，但蔡英文日前公开发言提及将“不断调整最适合的战斗队形，确保台湾不会被病毒打败”，陈时中是否会被撤换，再度引发外界联想。

台湾资深媒体人黄暐瀚13日在节目中提到，如果不是因为现任台湾地区副领导人赖清德在上一次“大选”前挑战蔡英文，蔡英文不得不安抚赖清德和他的支持者，她不会让陈建仁跑出来讲不接受续任。而蔡英文对陈建仁的信任度远远高过赖清德，陈建仁之所以能够被蔡英文这么信任，就是因为他“无害”，没政治企图心，因为陈建仁不会选2024。至于蔡英文2024的接班人，蔡英文应该还是比较属意桃园市长郑文灿。

黄暐瀚续指，民众对蔡英文不满，所以要找一个新的人出来，因为民众对陈时中的不满度越来越高，所以会换；非常有可能直接换陈建仁当行政机构负责人，然后由他来当指挥官。如果陈建仁真的主掌行政机构，他可以一直做到2024年。郑文灿接行政机构的梦，也就会暂时消下。况且“3+ 11”及诺富特事件，郑也受了重伤。

香港“中评社”发表文章指出，依照蔡的习惯，对于自己喜好的人，除非信任度已经低到不能再低，否则蔡应不会换掉第一线指挥官。但最近陈时中常遭外界的批评与质疑，一个不被信任的指挥官，若还要在第一线作战，只会让民进党当局的信任度再度下滑。

评论认为，赖清德和陈建仁都被点名是可能接任指挥官的适合人选，但蔡对赖清德信任度不高，对于陈建仁信任度较高，但陈建仁最近几次捍卫台产疫苗发言引发争议，这个出场前的铺陈，好像对恢复民进党当局的信任度没有多大效果。

评论指出，蔡英文目前应该还在观望疫情变化。目前台湾确诊本土病例已不在高峰期，加上疫苗陆续开打，换陈时中的可能性暂时不高。 除非疫情又有变化往上升，或等到疫情下降到一定程度，但陈时中的信任度却未见起色，甚至牵连到蔡英文民调时，蔡可能会考虑接替人选，而陈建仁接替可能性又会比赖清德高。